接种疫苗后，由于疫苗本身的特性，如异种蛋白的刺激，疫苗中的热原质或毒性等原因，少数被接种者可于接种灭活疫苗5～6小时，或24小时左右出现体温升高，一般持续1～2天左右，很少超过3天以上。
注射活疫苗出现反应的时间稍晚，但消失亦很快。除体温升高的反应外，个别人可能伴有头痛、眩晕、乏力和全身不适；或出现恶心、呕吐、腹泻等胃肠反应，一般1～2天可自行消失。
而若是恰好患有上呼吸道感染、腹泻或其它疾病时，一是有本身疾病的临床表现，如咳嗽、流涕、腹泻等表现外，有的可出现相应的体征。大便检查、胸片等可以帮助鉴别诊断，以排除是否接种时间上的偶合疾病。
既不要把一些适逢在免疫接种时期偶合的疾病误诊为接种副反应，而延误对疾病的治疗，也不要把真正的免疫接种副反应排除，忽视了与免疫接种的关系，这样不利于免疫接种的实施及生物制品质量的改进。